Pierre Aubert utilise à plusieurs reprises l'adresse de "Cologny" pour Genève.
Après son décès, survenu en 1636, ses héritiers (dont un fils apparemment également prénommé Pierre) continuent de publier sous son nom jusqu'en 1651 au moins, et l'imprimerie semble fonctionner jusqu'en 1660 environ, principalement pour le compte de Pierre 2 Chouet. 

Les hoirs de Pierre Aubert utilisent les ornements de leur père (dont certains proviennent de l'atelier de Jean Chiquelle) jusqu’en 1660 au plus tard ; des ornements se retrouvent ensuite chez Stoer entre 1664 et 1689, chez Gamonet en 1666 (rn0079-h seulement) et chez Samuel et Jean-Antoine de Tournes dès 1671. Une partie du matériel ornemental de ce dernier passe en 1677 à l’Imprimerie de Duillier (jusqu’en 1689 au moins). Une autre partie se retrouve dans l’atelier de Jean Pictet (1683), qui les revend vers 1687 à François Miège. Le matériel de Stoer passe quant à lui en bonne partie aux mains de François Jaquier, d’où il est réparti entre Jean Gallay et Barrillot (puis Pellet). Enfin, une lettre ornée (rn0105-n) a toutefois abouti dans l’atelier de Jean-Antoine Chouet qui l’utilise en 1696 dans des circonstances non élucidées.